Рустам Минниханов родился 1 марта 1957 года в селе Новый Арыш Татарской АССР. В 1978 году окончил Казанский сельскохозяйственный институт, в 1986 году — Заочный институт советской торговли.
В 1996–1998 годах занимал пост министра финансов Татарстана. В 1998 году возглавил правительство республики.

Доктор экономических наук. Награжден Орденом Дружбы, Орденами «За заслуги перед Отечеством» четвертой степени и «За заслуги перед Республикой Татарстан», медалями «В память 300-летия Санкт-Петербурга» и «В память 1000-летия Казани».

Заслуженный мастер спорта. Женат, имеет двоих сыновей.